Jérémie Janot fait partie des joueurs historiques de l’AS Saint-Etienne. Formé au club, il a joué son premier match pro sous le maillot vert lors de la saison 1996-1997. Jérémie Janot a pourtant dû attendre cinq longues années et la saison 2002-2003 pour devenir un titulaire incontestable à l’ASSE. Champion de Ligue 2 en 2004, il est élu par ses pairs meilleur gardien du championnat durant cette même saison. Connu pour son excentricité, notamment celle de ses maillots, et son célèbre tatouage sur le crâne, Jérémie Janot devient rapidement un des meilleurs gardiens de L1 comme en témoigne son record d’invincibilité à domicile (1 534 minutes) lors de la saison 2004-2005. Incontournable à l'ASSE, Jérémie Janot perd cependant sa place au profit de Jody Viviani en début d'année 2008 suite à une blessure. Il la récupère à l'arrivée d'Alain Perrin. Cette saison, il sera en concurrence avec Vincent Planté.
Jérémie Janot est sous contrat jusqu'en juin 2011, date à laquelle il intègrera le staff technique comme entraîneur des gardiens.